La région est bordée par l'Océan Atlantique. Elle est également le domaine de 48 plans d'eau de toute taille. Les plus importantes étendues d'eau sont :
Lac de Vioreau
La région Pays de Loire est de part ses pistes cyclables le théatre de voies vertes, vélorails et/ou véloroutes favorisant le tourisme à vélo :
la voie verte depuis la Roche sur Yon jusqu'à Coëx : 31 km
la vélocéan nord Loire (voie verte) depuis Piriac sur Mer jusqu'à Saint Nazaire : 46 km
la véloroute sud Vendée depuis l'Aiguillon sur Mer jusqu'à Maillezais : 83 km
la Loire à vélo en Maine et Loire (véloroute) depuis Montsoreau jusqu'à Liré : 126 km
